加熱調理した場合、コラーゲン分子は三重らせんの一部がほぐれてゼラチンに変性する(魚類のコラーゲンの変性温度はヒト体温よりも低い)。コラーゲンの分子構造を保ったまま腸内へと摂取することを望む場合はデメリットとなるが、ゼラチンはプロテアーゼによる分解を受けやすくアミノ酸供給源としては吸収されやすくなっている。